Las inversiones y gastos elegibles de los programas de ayudas cofinanciados por el FEDER están sujetos a normativa específica además de la reflejada en la Orden de Bases reguladora de la ayuda.
Además de la normativa europea de aplicación que se describe más adelante, es de aplicación la Orden HFP/1979/2016, de 29 de diciembre, por la que se aprueban las normas sobre los gastos subvencionables de los programas operativos del Fondo Europeo de Desarrollo Regional para el período 2014-2020. En ella se detallan las normas generales sobre la elegibilidad de los gastos, se enumeran los gastos que no son subvencionables por el FEDER, se establecen las condiciones específicas relativas a los gastos subvencionables en función de su ubicación y se hace referencia a las normas aplicables a las subvenciones y a la asistencia reembolsable.